Kakeru est un lycéen de 15 ans qui s’ennuie dans sa vie "trop normale". Le jour où sa mère le laisse seul pour partir en vacances avec ses soeurs, un vent de liberté souffle sur la maison. Jeux vidéos et films coquins sont au programme, mais ses projets sont contrariés par l’apparition de ce qui semble être le fantôme d’une jeune fille nue dans sa chambre.
Kakeru se retrouve en fait projeté dans un monde où des adolescents dotés de pouvoirs "psy" sont pour suivis par une mystérieuse organisation...